补充住房公积金制度是住房公积金制度的一种补充，两者的基本特征是相同的，都是一种长期的住房储金，用于职工的住房消费，属于职工个人所有；补充住房公积金属于非强制性缴纳的社会保障项目。企业根据自身的业绩和管理需要可以自主决定是否替员工缴纳补充住房公积金。

1、补充公积金不需要单位强制缴纳，也就是说它的缴存是自愿的，针对住房公积金，可能有些单位就要被强制缴纳。

2、两者缴存的范围是不同的，如果需要缴纳补充公积金，有一定的限制。住房公积金是单位或者一些外企、事业单位按照一定的比例定期缴纳的。

3、缴纳比例不同，补充公积金单位缴纳的比例有一定的限制范围，住房公积金的缴纳比例是单位和个人共同缴纳，缴纳金额相同。

（华龙网综合）