2009年7月，重庆市委市政府根据《国务院关于推进重庆市统筹城乡改革和发展的若干意见》（国发〔2009〕3号）的要求成立重庆股份转让中心，具体承担探索场外市场建设任务，是全国首家设立的区域性股权市场。2013年2月，在重庆市委、市政府主导下，重庆股份转让中心完成公司制改造，成立了注册资本1.56亿元的重庆股份转让中心有限责任公司，为市属国有重点企业。

发展至今，重庆股份转让中心公司逐渐走出了一条既符合国家多层次资本市场战略，又适应重庆市情的场外市场发展道路，处于全国同类市场领先地位：全国首家实现非上市股份有限公司股权登记托管、挂牌企业股权质押融资及市场内部分层；率先探索“交易所+投行”模式，提出“投行带动投资、投资带动挂牌”理念；率先设立“中国（重庆）路演中心”和西部并购路演中心；最早与政府合作成立产业引导基金，并向市外输出服务；率先推出大数据融资平台，开发综合业务管理系统，实现业务信息化，已成为全国较有影响力的区域性股权市场。同时，公司管理规范，风控严格，自成立以来从未发生金融风险，市场功能发挥较好，创新能力较强。在上市资源培育方面，积极整合沪深北三大交易所资源，完善培育体系，挂牌企业达1994家。在加强企业服务方面，建设重庆基金创新服务基地，形成企业全链条服务体系，服务企业5000余家。在助力企业融资方面，累计帮助企业实现各类融资983.27亿元，其中债权融资266.62亿元、股权质押融资666.14亿元、定向增发50.51亿元，累计股权交易额447.85亿元。